序號 | 分析項目 | 類型 | 分析 | 備注 |
1 | 下機數據統計 | A | ||
2 | 數據質控 | A | ||
3 | 數據獲取 | A | ||
4 | Survey 分析 | A | ||
5 | 基因組拼裝 | A | ||
6 | 基因組拼裝效果評價 | A | ||
7 | 基因組拼裝完整性與連續性評估 | A | ||
8 | 重復序列分析 | A | ||
9 | 非編碼 RNA 預測 | A | ||
10 | 蛋白編碼基因預測 | A | ||
11 | 碳水化合物活性酶（CAZy）分析 | A | ||
12 | 細胞色素 P450 家族分析 | A | ||
13 | 蛋白編碼基因的序列比對 | A | ||
14 | 蛋白編碼基因的 GO 注釋 | A | ||
15 | 蛋白編碼基因的 eggNOG 注釋 | A | ||
16 | 蛋白編碼基因的 KEGG 注釋 | A | ||
17 | 蛋白編碼基因的 Swiss-Prot 注釋 | A | ||
18 | 蛋白編碼基因的結構域分析 | A | ||
19 | 序列比對分析 | A | ||
20 | SNP 分析 | A | ||
21 | InDel 分析 | A | ||
22 | 基因家族分析 | B | 基因組數量 ≥ 2 | |
23 | Venn 繪制 | B | 基因組數量 ≥ 2 | |
24 | 單拷貝基因的蛋白序列一致性分析 | B | 基因組數量 ≥ 3 | |
25 | 基因家族擴張和收縮分析 | B | 基因組數量 ≥ 3 | |
26 | dNdS 分析 | B | 基因組數量 ≥ 2 | |
27 | 基于全基因組單拷貝基因的進化樹重構 | B | 基因組數量 ≥ 3 | |
28 | 分歧時間估算 | B | 基因組數量 ≥ 3 | |
29 | 基因組數據上傳 | B | ||
30 | 基因組圈圖繪制 | A |
A：標準信息分析； B：信息分析。
基于單拷貝的全基因組進化分析
ω值分布圖
