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科研服務

ATAC-seq

     利用高通量測序檢測轉座酶易接近的染色質的技術。在 ATAC-seq 技術中,DNA 探針(作為轉座子發揮作用)通過酶促反應(轉座酶Tn5)被整合到基因組的開放區域,然后通過測序來鑒定這些區域。

     ATAC-seq 技術可以進行樣本之間差異的染色質開放位點的比較。ATAC-seq 技術作為檢測表觀遺傳-染色質開放狀態現象的方式,與樣本基因表達譜緊密相連,從靶標基因的表觀狀態關聯到表達水平,具有強大的數據挖掘作用。此外,通過關聯基因組、外顯子,染色質免疫共沉淀(組蛋白修飾或轉錄因子結合)測序信息,形成:表觀調控-基因組-基因表達的完整調控鏈。

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實驗設計:

實驗組 vs 對照組

測序模式:用Illumina Novaseq 6000測序,測序策略為PE150

生物學重復:推薦細胞系、模式生物做2-3次生物學重復;人的組織可以做1次生物學重復。


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