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科研服務(wù)

群體進(jìn)化

利用全基因組重測(cè)序或簡(jiǎn)化基因組測(cè)序(dd-RAD)技術(shù)獲得某物種自然群體各亞群的基因組信息,通過(guò)與參考基因組比對(duì)或聚類(lèi)分析的方法得到大量變異信息,基于SNP信息討論群體的遺傳結(jié)構(gòu)、基因交流情況、物種形成機(jī)制以及群體進(jìn)化動(dòng)態(tài)等生物學(xué)問(wèn)題。


群體進(jìn)化研究可以獲取物種的變異信息,從而獲得生物群體的遺傳特征。探究群體進(jìn)化可以為動(dòng)植物遺傳育種和瀕臨滅絕的動(dòng)植物保護(hù)等提供理論依據(jù),同時(shí)也可以為地球地質(zhì)、生態(tài)、氣候、歷史人類(lèi)活動(dòng)變化的研究提供生物學(xué)佐證。

產(chǎn)品參數(shù)




基于重測(cè)序

基于簡(jiǎn)化

測(cè)序平臺(tái)及模式

Illumina Novaseq, PE150

測(cè)序深度

>50x/個(gè)體

混合建庫(kù);Tag數(shù)≥20萬(wàn),平均10x/Tag

項(xiàng)目周期

標(biāo)準(zhǔn)分析40天

標(biāo)準(zhǔn)分析50天

樣本選擇

同一物種自然群體的不同亞種(或品系),每個(gè)亞群樣本數(shù)≥10; 群體數(shù)≥3;總體不少于30個(gè)樣本

DNA樣本量

總量≥0.5 μg,濃度≥10   ng/μl

(單個(gè)樣本)

總量≥0.5 μg,濃度≥10   ng/μl

(總樣本)

參考基因組

必須有參

無(wú)參或參考基因組較大


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