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群落多樣性組成譜測序

群落多樣性組成譜測序

群落多樣性組成譜測序以細菌 / 古菌 16S rRNA 基因可變區、真菌 18S r RNA 基因可變區或真菌 ITS(Internal transcribed  spacer)內轉錄間隔區等微生物特征序列(Signature sequence)為靶點,通過檢測序列的變異和數量,反映群落 中各類微生物物種的身份和豐度,從而快速解析群落物種分布特征,闡明樣本間多樣性和組成差異,進而發現差異相 關物種。


產品特點

1. 直接對群落樣本中的微生物特征序列進行擴增檢測,簡單快速,并克服了大部分微生物無法

純培養的難題;

2. 自動化、專業的 DNA 提取流程,配合高保真 DNA 聚合酶進行 PCR 擴增,并嚴格把控擴增循環數,確保

群落組成客觀真實;

3. 使用 Illumina NovaSeq/MiSeq 和 PacBio Sequel II 進行測序, 2×250 bp、2×300 bp、>1 kb 的多種長

度均可適配,每個樣本都能一次性獲得數萬條序列,即使低豐度物種也能定量;

4. 采用 QIIME 2 分析流程, DADA2、物種注釋、PICRUSt2 功能潛能預測等方法覆蓋;

5. 提供分析結果,和發表等級的動態交互可視化效果。



項目流程

微生物組總DNA提取→目標片段PCR擴增→擴增產物檢測定量→測序文庫制備→上機進行高通量測序→生信分析


分析內容

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