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Small RNA測序

Small RNA介紹

Small RNA ,長度在 18-30nt,主要包括 miRNA、 siRNA 和 piRNA。在基因表達調控、生物個體發育、代謝及疾病的發生等生理過程中起著重要的作用。Small RNA 測序采用 Illumina 測序平臺,研究某一物種特定組織在特定狀態下的已知 Small RNA,也可發現新的物種或組織特異Small RNA并預測其靶基因,為研究 Small RNA 的功能及此物種的基因調控機制提供了有力工具,已廣泛應用于動植物的研究和醫學領域。



Small RNA測序方案設計

Small RNA 實驗設計思路為差異比較,常見的類型為實驗組與對照組(case VS control),進行兩兩比較;若考慮時空因素,如按照不同生長發育階段或者疾病發生發展整個過程進行比較,即進行多重比較分析,然后對差異的miRNA 進行靶基因預測和富集分析。一組樣品建議至少 6 個生物學重復。




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