分析項目 | 類別 | 分析 | 備注 | |
1. | 原始數據整理、過濾及質量評估 | A | √ | |
2. | 參考基因組注釋整理與統計 | A | √ | |
3. | A | √ | ||
4. | 基因表達量統計 | A | √ | |
5. | A | √ | ||
6. | A | √ | ||
7. | A | 內部生物學重復之間 | ||
8. | A | 樣品數 ≥3 | ||
9. | 基因表達差異分析 | A | √ | 樣品數≥2 |
10. | A | 基因或樣品≥3 | ||
11. | PCA分析 | A | √ | |
12. | 表達差異基因GO富集分析 | A | √ | |
13. | 表達差異基因KEGG通路富集分析 | A | √ | |
14. | 表達差異基因聚類分析 | A | √ | |
15. | cSNP分析 | A | √ | |
16. | 可變剪切分析 | A | √ | |
17. | UTR分析 | A | √ | |
18. | 新轉錄位點分析 | A | √ | |
19. | B | 實驗分組≥3 | ||
20. | B | 提供客戶軟件及使用方法 | ||
21. | B | 需要有生物學重復 | ||
22. | B | 需要有生物學重復 | ||
23. | B | √ | 客戶提供關注蛋白 | |
24. | B | 要求基因組完成圖 | ||
25. | B | 樣品數≥20 |
圖1 樣品相關性檢驗
圖2 基因差異表達火山圖
圖3 不同組間的差異
圖4 基因有向無環圖
