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科研服務

真核有參轉錄組測序

常見問題

  • 簡述真核轉錄組常規建庫流程

    1)通過磁珠和mRNA的polyA結構將mRNA分離出來;

    2)mRNA片段化;

    3)mRNA反轉錄為雙鏈結構,第二鏈cDNA合成時,其中的堿基T,被替換成U,從而達到鏈特異性文庫的目的;

    4)5’末端修復、3’末端加A;

    5)加接頭;

    6)選擇特異長度回收,一般為300bp;

    7)PCR;

    8)上機測序。


  • 如何對得到的數目較多的差異基因進行后期驗證?

    首先根據GO或者KEGG富集結果,或者客戶關注的基因,選取有代表性的進行qRT-RCR驗證。然后根據RPKM值,選擇RPKM值差異倍數答,同時p值小的基因進行qRT-RCR驗證。                                    

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