哪些物種可以研究lncRNA？
要做lncRNA分析，對物種有以下要求：
a. 物種為真核生物；
b. 物種具有參考基因組；
c. 具有較為完整的注釋。
為什么lncRNA要測鏈特異性文庫？
測序后的數據分析可確定轉錄本是來自正義還是反義DNA鏈。與普通轉錄組測序相比，它更能準確地統計轉錄本的數量和確定基因的結構，同時可以發現更多的反義轉錄本，可以更好地鑒定antisense lncRNA。
lncRNA測序，構建文庫時為什么要去除rRNA？
lncRNA中只有lincRNA的3’端帶有polyA結構，其他lncRNA沒有polyA結構，因此，為了獲得更全的lncRNA信息，不建議采用oligo(dT)磁珠富集的方式。
什么是LncRNA測序？
LncRNA-長鏈非編碼RNA（Long noncoding RNA）是一類長度超過200nt的RNA分子，它們少有蛋白編碼潛能，并且能夠和DNA、RNA及蛋白質結合，以RNA的形式在多種層面上（表觀遺傳調控、轉錄調控以及轉錄后調控等）調控基因的表達水平。LncRNA測序是研究已有參考基因組物種的特定組織或細胞在某個特定時期轉錄出的LncRNA和mRNA。
LncRNA測序的條件
有參考基因組，并且有LncRNA注釋信息：常見的包括人、小鼠、大鼠、豬、牛、兔、斑馬魚、酵母、擬南芥、果蠅、秀麗線蟲；擬南芥、玉米、葡萄、金銀花、水稻、西紅柿、大豆。
