2017-05-08
梨是我們日常生活中最常見的水果之一，而且廣泛分布世界各地。梨最早起源于中國西部山區，而古羅馬人為梨的栽培與傳播做出了重要貢獻。據報道，梨的栽培已有2000~3000年的歷史，公元前1世紀就有40多種梨的栽培品種。目前在50多個國家都有梨的栽種，幾乎遍布各個大陸。之所以能有如此廣泛的分布，在于能夠培育出適應各地不同環境的品種。盡管有著廣泛的地理分布，但并沒有出現明顯的生殖隔離，這對新品種的繁育有著重要意義。
說到遺傳育種，就不得不提分子標記。分子標記在遺傳多樣性和遺傳關聯分析等研究領域有著重要應用。接下來小編為大家介紹一篇利用GBS（Genotyping-by-sequencing）技術對梨的遺傳多樣性及選擇印記進行研究的報道。
材料和方法
研究者選用來自亞洲品種、歐洲品種以及兩者雜交品種的214個個體作為研究材料。并對其相關性狀（果實硬度、大小、酸度及變形等）進行調查。通過GBS的方法對樣本進行測序。以P. × bretschneideri (cultivar ‘Suli’) 和P. communis(cultivar ‘Bartlett’)為參考基因組，對不同樣本進行變異檢測。
結果與討論
1.從GBS數據中獲得15000個高質量SNP 標記位點。其中歐洲種和亞洲種分別含有25%和11%的獨有等位基因。
2.通過NJ法構建無根進化樹，發現歐洲種和亞洲種之間存在明顯的群體分離現象。
3.通過群體結構分析，發現種間雜交物種有55%的遺傳物質來自亞洲祖先，45%的遺傳物質來自歐洲祖先。
4.不同樣本間的表型變異與遺傳分化有著顯著的關聯性。通過大數據量的選擇掃描分析確認了20多個離群SNP位點，這些位點可能是受到定向選擇或者跟選擇相關的位點。
總結
本文對選擇區域查找和基因型-表型聯合分析在生物適應和選擇印記研究中的應用進行了初步探討。該研究對于歐洲和亞洲梨的獨立進化的理解以及對于梨的適應性研究有著重要的意義。
